RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437212.7

TMPRSS4-201, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMPRSS4, Length 2,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-201ENST00000437212 CRISP1P54107 249 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 LHX8Q68G74 356 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TRIM69Q86WT6 500 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TAGAPQ8N103 731 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 NEIL2Q969S2 332 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLC30A2Q9BRI3 323 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SRRDQ9UH36 339 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PCM1Q15154 2024 aa15.17■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PCDH17O14917 1159 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 NPC1O15118 1278 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PRAMEF10O60809 474 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 IFNW1P05000 195 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PTPN2P17706 415 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PREPP48147 710 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 PRLHRP49683 370 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 Q6ZVL8 140 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 Q6ZVU0 165 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GAREM2Q75VX8 874 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ATCAYQ86WG3 371 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RNF130Q86XS8 419 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 LAS2Q8IYD9 372 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 FAM46DQ8NEK8 389 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SETD6Q8TBK2 473 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TMCO6Q96DC7 493 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 VPS35Q96QK1 796 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 OR5M11Q96RB7 305 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 DYRK4Q9NR20 520 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GULP1Q9UBP9 304 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TRBC2A0A5B9 178 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 J3KTA2 159 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 LEFTY2O00292 366 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ARHGAP33O14559 1287 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CHMP24386 653 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLC15A1P46059 708 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CASP9P55211 416 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RHAGQ02094 409 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SP3Q02447 781 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 C2orf80Q0P641 193 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ZNF558Q96NG5 402 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ZIC5Q96T25 663 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SIAEQ9HAT2 523 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SPG21Q9NZD8 308 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.16■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 M0R129 80 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 POU2F1P14859 743 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 HOXD10P28358 340 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SOAT1P35610 550 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ETV3P41162 512 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CRISP3P54108 245 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CARTPTQ16568 116 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 AGAP6Q5VW22 663 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 IKBIPQ70UQ0 350 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 AGAP4Q96P64 663 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 KCND3Q9UK17 655 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 RAB23Q9ULC3 237 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 A0A1W2PRB8 838 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 SLITRK5O94991 958 aa15.15■□□□□ 0.02
TMPRSS4-201ENST00000437212 ADAP00813 363 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms