RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 STUB1Q9UNE7 303 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 YDJCA8MPS7 323 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ABCD4O14678 606 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CILPO75339 1184 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 B3GALT4O96024 378 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HTR6P50406 440 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 JAG1P78504 1218 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DSC2Q02487 901 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CAMK2DQ13557 499 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ITPK1Q13572 414 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SEC23BQ15437 767 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SPHARQ15513 63 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 AMHR2Q16671 573 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ELP2Q6IA86 826 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM198BQ6UWH4 519 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 METTL6Q8TCB7 284 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA1191Q96A73 305 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FBXO17Q96EF6 278 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 APOL5Q9BWW9 433 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NMUR1Q9HB89 426 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 LACTBL1A8MY62 500 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 G3V3G9 751 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HAS3O00219 553 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NFICP08651 508 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DRD5P21918 477 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FPR3P25089 353 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TPI1P60174 286 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 9.3
TMOD1-203ENST00000395211 TRAM2Q15035 370 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NTRK2Q16620 822 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KYAT1Q16773 422 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 20
TMOD1-203ENST00000395211 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC115Q96NT0 180 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MAP3K3Q99759 626 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DPY30Q9C005 99 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ABCG4Q9H172 646 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NANSQ9NR45 359 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NDRG3Q9UGV2 375 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM50BQ9Y247 325 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 GSAPA4D1B5 854 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 A8MXK9 166 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DISC1C4P0D8 188 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM72CH0Y354 149 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 QSOX1O00391 747 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TGM6O95932 706 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 IL6P05231 212 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CRYBB2P43320 205 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 KCNJ5P48544 419 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 CASP6P55212 293 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DEF8Q6ZN54 512 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 FAM72BQ86X60 149 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM192Q8IY95 271 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB106AQ8N104 65 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OXR1Q8N573 874 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 WBP1Q96G27 269 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 PEX11GQ96HA9 241 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 MNTQ99583 582 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NLNQ9BYT8 704 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms