RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf141Q5JVX7 400 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARC1Q5VT66 337 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERINC5Q86VE9 423 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D10CQ8IV04 446 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC43A2Q8N370 569 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NME8Q8N427 588 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC191Q8NCU4 936 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMPDL3AQ92484 453 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZIM3Q96PE6 472 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PINK1Q9BXM7 581 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 GTF3C4Q9UKN8 822 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 POGZQ7Z3K3 1410 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM86B1E9PN63 330 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC188H7C350 402 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6B1O95007 311 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALCAP01258 141 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 GBAP04062 536 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPN1P04843 607 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD34CP0C6C1 535 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTAFRP25105 342 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAD23AP54725 363 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 BACE1P56817 501 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTENP60484 403 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC22A6Q4U2R8 563 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCE3AQ5TA76 89 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SHEQ5VZ18 495 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELMOD1Q8N336 334 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LSMEM1Q8N8F7 131 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 OCC1Q8TAD7 63 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRAPQ8TCY5 172 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD99L2Q8TCZ2 262 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIPHQ8WWY8 451 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOC4Q96A65 974 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RCHY1Q96PM5 261 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGME1Q9BQP7 344 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10A4Q9H209 315 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRO0461Q9UI25 63 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3GLB1Q9Y371 365 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 UMODL1Q5DID0 1318 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PQ72 361 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMCO5BA8MYB1 307 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANHXE9PGG2 379 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FIBPO43427 364 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LY6G6DO95868 133 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHG1P01857 330 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 VIMP08670 466 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPY4RP50391 375 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPZA1P52907 286 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NAGLUP54802 743 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUCB1Q02818 461 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX35Q5T0J7 233 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM91A1Q658Y4 838 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHL10Q6JEL2 608 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARMCX5Q6P1M9 558 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCGF5Q86SE9 256 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARP8Q8N3A8 854 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 C11orf42Q8N5U0 333 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIT1Q92963 219 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC35C1Q96A29 364 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYYR1Q96J86 154 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 B3GALT6Q96L58 329 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSD17B14Q9BPX1 270 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 INPP5KQ9BT40 448 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM7Q9C029 511 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIME1Q9H400 295 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 249.7 ms