RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 PRPH2P23942 346 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 SSR2P43308 183 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 GSTA3Q16772 222 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 AP5B1Q2VPB7 878 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 CHTF18Q8WVB6 975 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 LRTM1Q9HBL6 345 aa28.03■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 FER1L5A0AVI2 2057 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 NPIPB8E9PQR5 432 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 PEX11AO75192 247 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 STK17BO94768 372 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL18O94889 574 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 BSGP35613 385 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 ARFIP1P53367 373 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 ERVK-8P63133 956 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF793Q6ZN11 406 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD6Q7Z4G1 85 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 MVB12AQ96EY5 273 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 PPP3R2Q96LZ3 170 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 QRFPRQ96P65 431 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 B3GNT4Q9C0J1 378 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf109Q9NX04 203 aa28.02■■■□□ 2.08
ECHS1-201ENST00000368547 SGK494L7N484 410 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 NVLO15381 856 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SEC22BO75396 215 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 NSA2O95478 260 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MNAT1P51948 309 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ACSM2AQ08AH3 577 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 RTP5Q14D33 572 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SPIN4Q56A73 249 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ACSM2BQ68CK6 577 aa28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 A0A088AWK7 358 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF860A6NHJ4 632 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 IDO1P14902 403 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3R1P27986 724 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SLC5A2P31639 672 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 TSFMP43897 325 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 AVPR1BP47901 424 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 C6orf136Q5SQH8 315 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 IGF2-ASQ6U949 168 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ASRGL1Q7L266 308 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT13Q86X67 352 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 AMER3Q8N944 861 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 GBP5Q96PP8 586 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 AK5Q9Y6K8 562 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MAU2Q9Y6X3 613 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 TRABD2BA6NFA1 517 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 EEDO75530 441 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 GBAP04062 536 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN8OSP0DMR3 200 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 CERS1P27544 350 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 RORAP35398 523 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 OR1D4P47884 311 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MTTPP55157 894 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 STX1BP61266 288 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SKP1P63208 163 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PRMT9Q6P2P2 845 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT4Q8N9L9 421 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PROKR1Q8TCW9 393 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ROGDIQ9GZN7 287 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 LRMDAQ9H2I8 198 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ASCL3Q9NQ33 180 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 CDC14AQ9UNH5 594 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa28■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SDK2Q58EX2 2172 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 CDRT15L2A8MXV6 281 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 RDH16O75452 317 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 KLK1P06870 262 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ITGAXP20702 1163 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 RPL38P63173 70 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 EMX2Q04743 252 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ABHD18Q0P651 414 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0040Q15053 153 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 NIPAL1Q6NVV3 410 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PAGE2Q7Z2X7 111 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZFAND4Q86XD8 727 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 PARP9Q8IXQ6 854 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT6Q8NCL4 622 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 MARK4Q96L34 752 aa27.99■■■□□ 2.07
ECHS1-201ENST00000368547 SERINC2Q96SA4 455 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms