RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OPA3Q9H6K4 179 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RNF186Q9NXI6 227 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRODH2Q9UF12 536 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 J3QR89 54 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MEIS2O14770 477 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR10H2O60403 315 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MMP20O60882 483 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR2B3O76000 313 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EGFP01133 1207 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HDCP19113 662 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HK1P19367 917 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CPN2P22792 545 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PCGF2P35227 344 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GALK1P51570 392 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN10P78369 228 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDKL1Q00532 357 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf57Q5W0N0 161 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO30Q8TB52 745 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GAL3ST1Q99999 423 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BCO2Q9BYV7 579 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PATJQ8NI35 1801 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AGAP5A6NIR3 686 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR5K4A6NMS3 321 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 E5RJQ4 531 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF208O43345 1280 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PCDH8O95206 1070 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RLN1P04808 185 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GIMD1P0DJR0 217 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ARL2P36404 184 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GLP1RP43220 463 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AVPR1BP47901 424 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MASP1P48740 699 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRPS1P60891 318 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FUT2Q10981 343 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CD163Q86VB7 1156 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RNF130Q86XS8 419 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR56B4Q8NH76 319 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A7Q92504 469 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF559Q9BR84 538 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 POLD4Q9HCU8 107 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 DAPL1A0PJW8 107 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC72A6NJI9 287 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HTR3BO95264 441 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HRGP04196 525 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LINGO3P0C6S8 592 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TPH1P17752 444 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR3A3P47888 321 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR3A2P47893 321 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CRADDP78560 199 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PPP2R2BQ00005 443 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PPA1Q15181 289 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ELP2Q6IA86 826 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 AHSA2Q719I0 299 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SERINC5Q86VE9 423 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SNX27Q96L92 541 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SFXN2Q96NB2 322 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CIB1Q99828 191 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP26Q9BV47 211 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RDH14Q9HBH5 336 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 COG5Q9UP83 839 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 H7C417 338 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ARNTLO00327 626 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 INSIG1O15503 277 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SULT1C4O75897 302 aa4.75□□□□□ -1.65
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