RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264454.7

SEC22C-201, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC22C, Length 1,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-201ENST00000264454 TIPRLO75663 272 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 KCNK5O95279 499 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 WNT1P04628 370 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 UQCRC2P22695 453 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 MAGEA8P43361 318 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 FASLGP48023 281 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PLA2G16P53816 162 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 HBA1P69905 142 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 MC1RQ01726 317 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 HHEXQ03014 270 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RBBP4Q09028 425 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 HYAL2Q12891 473 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RGNQ15493 299 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TEAD4Q15561 434 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 VMACQ2NL98 169 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SPESP1Q6UW49 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ASPGQ86U10 573 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RSC1A1Q92681 617 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZNF570Q96NI8 536 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 BDH2Q9BUT1 245 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 LRRC61Q9BV99 259 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RAB26Q9ULW5 256 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 USP22Q9UPT9 525 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 LRP4O75096 1905 aa9.51□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 OR5K3A6NET4 321 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PRR33A8MZF0 331 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 K7ESF4 209 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PDPK1O15530 556 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TMPRSS11DO60235 418 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C6orf47O95873 294 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 B3GALT4O96024 378 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 LDLRP01130 860 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 UQCRBP14927 111 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 NXPH1P58417 271 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 NHLH1Q02575 133 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SLAMF1Q13291 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C1orf61Q13536 156 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TCEA2Q15560 299 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ATP6AP1Q15904 470 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SFT2D3Q587I9 215 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 IRGCQ6NXR0 463 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C11orf74Q86VG3 221 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZZZ3Q8IYH5 903 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 OR10G6Q8NH81 332 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 NCLNQ969V3 563 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 RNF145Q96MT1 663 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 OR2A5Q96R48 311 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.5□□□□□ -0.89
SEC22C-201ENST00000264454 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms