RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256646.6

NOTCH2-201, Transcript of notch 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH2, Length 11,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-201ENST00000256646 SHOXO15266 292 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 OPN1LWP04000 364 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 STOMP27105 288 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 DAG1Q14118 895 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 CDNFQ49AH0 187 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 USP29Q9HBJ7 922 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SARDHQ9UL12 918 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 WASF3Q9UPY6 502 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EOMESO95936 686 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ETV3P41162 512 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ADGRF1Q5T601 910 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 Q9N2J8 555 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.6□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 LEFTY2O00292 366 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 CNTN5O94779 1100 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TMEM63AO94886 807 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 FAM217AQ8IXS0 508 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PRPS1L1P21108 318 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PEX13Q92968 403 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EPYCQ99645 322 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 IRF5Q13568 498 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 POT1Q9NUX5 634 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 FGF18O76093 207 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ADAP00813 363 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SLAMF1Q13291 335 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 C14orf80Q86SX3 495 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 C12orf40Q86WS4 652 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TTLQ8NG68 377 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 IMPDH1P20839 514 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 GMPRP36959 345 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 GLP1RP43220 463 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 DCAF12L1Q5VU92 463 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 A8MT66 165 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 H2BFMP0C1H6 154 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SLC18A1P54219 525 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PNLIPRP1P54315 467 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 INAVAQ3KP66 663 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 BEST1O76090 585 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TREML1Q86YW5 311 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 IFNL1Q8IU54 200 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 OR51A7Q8NH64 312 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 KLHL15Q96M94 604 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 DISC1C4P0D8 188 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 H3BSA7 217 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PRDX6P30041 224 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 MOGSQ13724 837 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TMEM80Q96HE8 168 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 GPR4P46093 362 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 GAS6Q14393 721 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 FBXL16Q8N461 479 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 OR2T29Q8NH02 315 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 IL17FQ96PD4 163 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.59□□□□□ -0.87
NOTCH2-201ENST00000256646 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.58□□□□□ -0.88
NOTCH2-201ENST00000256646 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
NOTCH2-201ENST00000256646 POU3F4P49335 361 aa9.58□□□□□ -0.88
NOTCH2-201ENST00000256646 SEC23BQ15437 767 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms