RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	ELOC	Q15369	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	P3H1	Q32P28	736 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NAGS	Q8N159	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	EID2B	Q96D98	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRT12	Q99456	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CTRC	Q99895	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ABCG8	Q9H221	673 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PAK5	Q9P286	719 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPTA1	P02549	2419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		A0A1W2PQ67	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		A8MU76	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		E7EVH7	732 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		H3BUI4	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TTI1	O43156	1089 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PSMD3	O43242	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAD51C	O43502	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DUX1	O43812	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC28A2	O43868	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KRT38	O76015	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CLDN7	O95471	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NDST3	O95803	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TOMM40	O96008	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	APRT	P07741	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SBK3	P0C264	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PIRT	P0C851	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TPH1	P17752	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAL	P21145	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC7A1	P30825	629 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FDFT1	P37268	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CDK3	Q00526	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OLIG2	Q13516	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PTK6	Q13882	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GALNT3	Q14435	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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