RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	IL10RB	Q08334	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PARP15	Q460N3	678 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087X0M5	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GX30	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RNF103	O00237	685 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	INSIG1	O15503	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TIMM44	O43615	452 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GAS8	O95995	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CLEC3B	P05452	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MYF6	P23409	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARRB2	P32121	409 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GRIA1	P42261	906 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RGR	P47804	291 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00205	P59089	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ABAT	P80404	500 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PTK6	Q13882	451 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DMC1	Q14565	340 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FUT11	Q495W5	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SNAPC3	Q92966	411 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms