RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 C1orf189Q5VU69 101 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 ANKRD46Q86W74 232 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 PIGXQ8TBF5 258 aa8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 GLYATL1Q969I3 302 aa8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 CIB1Q99828 191 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF221Q9UK13 617 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.3□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 KCTD3Q9Y597 815 aa8.3□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 CEP250Q9BV73 2442 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 CD70P32970 193 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 LIMK2P53671 638 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 SLCO2A1Q92959 643 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 AGR2O95994 175 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 RENP00797 406 aa8.29□□□□□ -1.08
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CLIP1-218ENST00000545889 ID2Q02363 134 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.082e-8■■□□□ 11.9
CLIP1-218ENST00000545889 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.29□□□□□ -1.08
CLIP1-218ENST00000545889 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.29□□□□□ -1.08
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