RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ALPPP05187 535 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ANPEPP15144 967 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 BMP7P18075 431 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 METAP1P53582 386 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 INHBCP55103 352 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IFI44LQ53G44 452 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SFRP1Q8N474 314 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SERINC2Q96SA4 455 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 SORT1Q99523 831 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CHRDQ9H2X0 955 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TM9SF3Q9HD45 589 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TTC36A6NLP5 189 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CD247P20963 164 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 UQCRC2P22695 453 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CCKBRP32239 447 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CASRP41180 1078 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 POLE2P56282 527 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MTAPQ13126 283 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GPR18Q14330 331 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GGTA1PQ4G0N0 100 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF527Q8NB42 609 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TCTN2Q96GX1 697 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CD180Q99467 661 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf4Q9NR00 106 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 POMPQ9Y244 141 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 HMX2A2RU54 273 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 AQP12BA6NM10 295 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 IQCHQ86VS3 1027 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 A0A096LPI6 279 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TP73O15350 636 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 COL9A1P20849 921 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 ASB9Q96DX5 294 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.92□□□□□ -1.14
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PTPRD-211ENST00000486161 APIPQ96GX9 242 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 S100A14Q9HCY8 104 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-211ENST00000486161 GFYI3L273 518 aa7.91□□□□□ -1.14
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