RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA1328Q86T90 577 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 RNF214Q8ND24 703 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 CD200R1Q8TD46 325 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 DHRS7Q9Y394 339 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 A6NNC1 897 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 G3V3Y1 287 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 CCND1P24385 295 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 CCR8P51685 355 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ASB15Q8WXK1 588 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 SLCO2A1Q92959 643 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 VMP1Q96GC9 406 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 HES6Q96HZ4 224 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 C18orf12Q96KH6 178 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 CCDC77Q9BR77 488 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ZFATQ9P243 1243 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 PDE10AQ9Y233 779 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 RAF1P04049 648 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 RNH1P13489 461 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 PEX19P40855 299 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 C1orf185Q5T7R7 199 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 IL20RBQ6UXL0 311 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 GK5Q6ZS86 529 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 NCLNQ969V3 563 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 SGPP1Q9BX95 441 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 ACAD8Q9UKU7 415 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRA-208ENST00000455631 TRBC2A0A5B9 178 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 WDR1O75083 606 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 OR2J2O76002 312 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 IGHG3P01860 377 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HNF4AP41235 474 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 MAGEA5P43359 124 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 RAB8AP61006 207 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CTBP1Q13363 440 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 DEFB113Q30KQ7 82 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FLYWCH1Q4VC44 716 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FBXW10Q5XX13 1052 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM198Q66K66 360 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CASC4Q6P4E1 433 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CLEC9AQ6UXN8 241 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TRILQ7L0X0 811 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FAM109AQ8N4B1 249 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 NT5CQ8TCD5 201 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HAUS8Q9BT25 410 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ALKBH4Q9NXW9 302 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 AQP7O14520 342 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 GLSO94925 669 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 OR6B1O95007 311 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 INHBBP09529 407 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 NPPBP16860 134 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 KEAP1Q14145 624 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TERF2Q15554 542 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TMEM251Q8N6I4 163 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SARGQ9BW04 601 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 B4GALT7Q9UBV7 327 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 CBLCQ9ULV8 474 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 EML6Q6ZMW3 1958 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 VPS13CQ709C8 3753 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 A0A1B0GVC2 190 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ZFAND5O76080 213 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 C8GP07360 202 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SOX3P41225 446 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 MAN2A2P49641 1150 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 TERF1P54274 439 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 XKR6Q5GH73 641 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 WLSQ5T9L3 541 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 PALM2Q8IXS6 379 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 FAM222BQ8WU58 562 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTPRA-208ENST00000455631 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms