RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NRG4Q8WWG1 115 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KCNC2Q96PR1 638 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM15Q9C019 465 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 POMT2Q9UKY4 750 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 USP22Q9UPT9 525 aa14.73□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 THADAQ6YHU6 1953 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LILRA5A6NI73 299 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LAMTOR5O43504 91 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ANP32DO95626 131 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SSR2P43308 183 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GZMMP51124 257 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR4D2P58180 307 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TEAD4Q15561 434 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ASPGQ86U10 573 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C11orf74Q86VG3 221 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AMER3Q8N944 861 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RSC1A1Q92681 617 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LRGUKQ96M69 825 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1B0GTW7 788 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1B0GVT2 93 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C1orf226A1L170 272 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GPR37L1O60883 481 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 BAG2O95816 211 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ANXA6P08133 673 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CTSKP43235 329 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SESN3P58005 492 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PROSER1Q86XN7 944 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MMP21Q8N119 569 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FAM47BQ8NA70 645 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR2T12Q8NG77 320 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR10A6Q8NH74 314 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GAB3Q8WWW8 586 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.72□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 UBXN7O94888 489 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SCELO95171 688 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 STATHP02808 62 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PPP1CAP62136 330 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RGS1Q08116 209 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KLHL35Q6PF15 583 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RNF44Q7L0R7 432 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NATD1Q8N6N6 113 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.71□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 A0A0G2JN53 185 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 CLIC1O00299 241 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SDC3O75056 442 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 EPN2O95208 641 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 PVRP15151 417 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 TYRP1P17643 537 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 GPX2P18283 190 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 GGT1P19440 569 aa14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SLC7A1P30825 629 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms