RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A8Q9BY19 250 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALT2O60909 372 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBP1P09455 135 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G16P53816 162 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNC4Q03721 635 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNX2Q13950 521 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC29A2Q14542 456 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSDHLQ15738 373 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFT2D3Q587I9 215 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED27Q6P2C8 311 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00696Q6ZRV3 163 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRT6Q8N6T7 355 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPT1CQ8TCG5 803 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2E3Q969T4 207 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCYL1Q96KG9 808 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 F2RL3Q96RI0 385 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLMPQ9H6B4 373 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGFRNQ9P2B2 879 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLNCQ14315 2725 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM227AF5H4B4 570 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 E2F3O00716 465 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCNAP12004 261 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 CERS1P27544 350 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF8P28908 595 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTG2P78543 158 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2H2Q13888 395 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAG1Q6DJT9 500 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUZD1Q86UP6 607 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7G3Q8NG95 312 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 FETUBQ9UGM5 382 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMCO1Q9UM00 188 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A088AWK7 358 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GALT2O43825 422 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBK3P0C264 359 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICAM2P13598 275 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAOAP21397 527 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB1P30740 379 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB38P57729 211 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP2B1P63010 937 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTBD16Q32M84 506 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGSNQ5TDP6 509 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE3DQ7Z6J8 389 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTBPQ96DY7 904 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTCHD1Q96NR3 888 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMF1Q96S06 567 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERINC2Q96SA4 455 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR8Q9H981 624 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 RELNP78509 3460 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX16O14662 325 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT3O60678 531 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3CGP48736 1102 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTTPP55157 894 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4D2P58180 307 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPJQ5W064 366 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQCKQ8N0W5 287 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF175Q8N4F7 328 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 MZB1Q8WU39 189 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF21BQ96EK2 531 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNC2Q96PR1 638 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF3RQ99062 836 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR4Q99677 370 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPPKQ9H8X2 491 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 NECTIN3Q9NQS3 549 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms