RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SZT2Q5T011 3432 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIT2A6NDA9 550 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 URADA6NGE7 173 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 LAMP1P11279 417 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ANPEPP15144 967 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GNSP15586 552 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R50P59544 299 aa9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 RGS1Q08116 209 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT8Q16880 541 aa9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF425Q6IV72 752 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FIGLAQ6QHK4 219 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OOSP2Q86WS3 158 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT13Q86X67 352 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PROSER1Q86XN7 944 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOA3Q8NG57 546 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10G6Q8NH81 332 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR48Q8TAF3 677 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.872e-8■■■■□ 22.7
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT8Q8WV74 236 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NELL1Q92832 810 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PPCDCQ96CD2 204 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2A14Q96R47 310 aa9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.65□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.65□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP12BA6NM10 295 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 B4DGG1 531 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 PLPP1O14494 284 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HAT1O14929 419 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTA4O15217 222 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 YY2O15391 372 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFS4O43181 175 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP9O43315 295 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT2B7P16662 529 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 BCL6P41182 706 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4F3Q08477 520 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A5Q14940 896 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZIC1Q15915 447 aa9.64□□□□□ -0.87
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RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PLD3Q8IV08 490 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL6Q8N531 539 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.64□□□□□ -0.87
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