RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 OR1L3Q8NH93 324 aa22.82■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.82■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.8■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 TEX37Q96LM6 180 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKHQ9HCJ1 492 aa22.8■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.8■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.8■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 C10orf90Q96M02 699 aa22.8■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 LRATO95237 230 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.79■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 C21orf58P58505 322 aa22.79■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.79■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 HPCAL1P37235 193 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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CCDC71L-201ENST00000315965 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.78■■□□□ 1.24
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.78■■□□□ 1.24
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