RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF639Q9UID6 485 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 SNX7Q9UNH6 387 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXD8-201ENST00000313173 LRIT2A6NDA9 550 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PRSS23O95084 383 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 RGNQ15493 299 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ADRM1Q16186 407 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TRIML2Q8N7C3 387 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 GPR27Q9NS67 375 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 CHN2P52757 468 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZP2Q05996 745 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 GAS6Q14393 721 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 HEPACAMQ14CZ8 416 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 CLEC4FQ8N1N0 589 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 AICDAQ9GZX7 198 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PRB8 838 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DDX5P17844 614 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 VEZF1Q14119 521 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 NATD1Q8N6N6 113 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 CNBD2Q96M20 576 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 NTN4Q9HB63 628 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R9Q9NYW1 312 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 UBAP1Q9NZ09 502 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 BTN3A3O00478 584 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS11DO60235 418 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF217O75362 1048 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 FKBP9P1Q75LS8 142 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD9Q8NBP5 474 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SLC22A18Q96BI1 424 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PYURFQ96I23 114 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0A6YYD5 115 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PPC4 97 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 UPK1AO00322 258 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 NTRK1P04629 796 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 NHSL2Q5HYW2 709 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 IYDQ6PHW0 289 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJB9Q9UBS3 223 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 A6NHS1 94 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 THEGLP0DJG4 465 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF23P17027 643 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 SSR2P43308 183 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 MVDP53602 400 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PLA2G16P53816 162 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 HYAL2Q12891 473 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 FZD5Q13467 585 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 KIR2DS3Q14952 304 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM48Q8IWZ4 208 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 OR52N2Q8NGI0 321 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZFPM2Q8WW38 1151 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf62Q9BQA9 187 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM4Q9C037 500 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 LTB4R2Q9NPC1 389 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 EI24O14681 340 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 KDELR2P33947 212 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ARFIP1P53367 373 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 FZD2Q14332 565 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PLCL1Q15111 1095 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 PAQR7Q86WK9 346 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 FRMD1Q8N878 549 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 ORAI3Q9BRQ5 295 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL31Q9H511 634 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 RPS6KA6Q9UK32 745 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL20Q9Y2M5 609 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 DLGAP1O14490 977 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXD8-201ENST00000313173 NUDT7P0C024 238 aa25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms