RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 RAB33AQ14088 237 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CARM1Q86X55 608 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC29A1Q99808 456 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GLOD5A6NK44 160 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 DRGXA6NNA5 263 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GPX3P22352 226 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 29.8
SCARB2-201ENST00000264896 GRIA2P42262 883 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GRHL3Q8TE85 626 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.96■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CCRL2O00421 344 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GINS1Q14691 196 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CD9P21926 228 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 BMP8BP34820 402 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A24Q6NUK1 477 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF675Q8TD23 568 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 RAB7BQ96AH8 199 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 PIP5K1AQ99755 562 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CREBZFQ9NS37 354 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MARK1Q9P0L2 795 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MED31Q9Y3C7 131 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 HUS1BQ8NHY5 278 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 BIRC8Q96P09 236 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.95■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SMU1Q2TAY7 513 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 HSDL2Q6YN16 418 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM2Q9C040 744 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ENTPD6O75354 484 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF823P16415 610 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CD70P32970 193 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MAP2K4P45985 399 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CHST4Q8NCG5 386 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 LGALS12Q96DT0 336 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MCHR1Q99705 422 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ABCG4Q9H172 646 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 VEGFDO43915 354 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 IST1P53990 364 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 NDC1Q9BTX1 674 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 COQ9O75208 318 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGEF15O94989 841 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 RENP00797 406 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 HSF2Q03933 536 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 LRP8Q14114 963 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 HMGB4Q8WW32 186 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 RNF186Q9NXI6 227 aa16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 SLC1A7O00341 560 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ARL6IP5O75915 188 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 MAGEA3P43357 314 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 DCDC1P59894 354 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ENPP2Q13822 863 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.93■□□□□ 0.3
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC116Q8IYX3 515 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms