RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8orf44	Q96CB5	159 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MTBP	Q96DY7	904 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LHPP	Q9H008	270 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS11	Q9H270	941 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OPTC	Q9UBM4	332 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMCO1	Q9UM00	188 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ASB1	Q9Y576	335 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MASP2	O00187	686 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS4B	O75351	444 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	JRK	O75564	520 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ICAM2	P13598	275 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GFAP	P14136	432 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EPB42	P16452	691 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD22	P20273	847 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ITGA3	P26006	1051 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GCA	P28676	217 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TNFRSF8	P28908	595 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EFNA3	P52797	238 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AP2B1	P63010	937 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501		Q0VFX4	171 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHIT1	Q13231	466 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAPSN	Q13702	412 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PFKFB4	Q16877	469 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TM9SF4	Q92544	642 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AGAP4	Q96P64	663 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LANCL2	Q9NS86	450 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	VPS4A	Q9UN37	437 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501		A0A088AWK7	358 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST10	O43529	356 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	UGDH	O60701	494 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	FH	P07954	510 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	JAK1	P23458	1154 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SERPINB1	P30740	379 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	HNF4A	P41235	474 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PIK3CG	P48736	1102 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB8A	P61006	207 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHAG	Q02094	409 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCOLCE	Q15113	449 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LCA5	Q86VQ0	697 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LAS2	Q8IYD9	372 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SHISA5	Q8N114	240 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	LMF1	Q96S06	567 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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