RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564343.5

TCF4-223, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 4

Gene TCF4, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-223	ENST00000564343	PDHA2	P29803	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CXCR5	P32302	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PRLHR	P49683	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PER3	P56645	1201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KCNK10	P57789	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C21orf58	P58505	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	DYNLT1	P63172	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CDC16	Q13042	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PRKG2	Q13237	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MPP3	Q13368	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OLIG2	Q13516	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KRT33B	Q14525	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	GBX1	Q14549	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PDK1	Q15118	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ASB8	Q9H765	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343		A0A1B0GUH1	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KLHL41	O60662	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	JRK	O75564	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	WISP2	O76076	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SPDEF	O95238	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AGT	P01019	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	EPO	P01588	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	IGHE	P01854	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SERPING1	P05155	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MTHFD2	P13995	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	UGT2B7	P16662	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MMP11	P24347	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LMO1	P25800	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ECHS1	P30084	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MTNR1B	P49286	362 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	HCFC1	P51610	2035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	CHN2	P52757	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	XIAP	P98170	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343		Q0VFX4	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	SP140	Q13342	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ART3	Q13508	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	MESD	Q14696	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-223	ENST00000564343	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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