RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PCSK4Q6UW60 755 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MREGQ8N565 214 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EXD3Q8N9H8 876 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RDH11Q8TC12 318 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NTMT1Q9BV86 223 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR83Q9NYM4 423 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 C5AR2Q9P296 337 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PQ72 361 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 E2F3O00716 465 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 COPEO14579 308 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ALOX12BO75342 701 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CEACAM4O75871 244 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 STATHP02808 62 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FHP07954 510 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GMPRP36959 345 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL11P51671 97 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MTTPP55157 894 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ASPHQ12797 758 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT16Q8N428 558 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR7G3Q8NG95 312 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SERINC2Q96SA4 455 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF358Q9NW07 568 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SENP1Q9P0U3 644 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PPT2Q9UMR5 302 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SPTA1P02549 2419 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SMIM23A6NLE4 172 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 A8MT66 165 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CLDN4O14493 209 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SOCS6O14544 535 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 DPM1O60762 260 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MLYCDO95822 493 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SHBGP04278 402 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CRHR1P34998 444 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO1A2P46721 670 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAP1GDS1P52306 607 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HERVK_113P63132 956 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 IFT88Q13099 833 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MYBPC3Q14896 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PDSS2Q86YH6 399 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MZB1Q8WU39 189 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MOCOSQ96EN8 888 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SMIM10Q96HG1 83 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 PCTPQ9UKL6 214 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB21Q9UL25 225 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 TLDC2A0PJX2 215 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 CHST10O43529 356 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 MYL2P10916 166 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 EPORP19235 508 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGA3P26006 1051 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB8AP61006 207 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 BTN3A2P78410 334 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 HYAL2Q12891 473 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-205ENST00000558534 KLRB1Q12918 225 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms