RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	NTMT1	Q9BV86	223 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PPM1	405 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	LRIT2	A6NDA9	550 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549		H0YIV9	168 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PEX12	O00623	359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	FFAR3	O14843	346 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GPR42	O15529	346 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL41	O60662	606 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	KLHL18	O94889	574 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SBK3	P0C264	359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CD22	P20273	847 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CRHR1	P34998	444 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PGD	P52209	483 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PHF21B	Q96EK2	531 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1W2PQ72	361 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549		A8MT66	165 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549		H3BQF6	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA8R	I6L899	631 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	AGPS	O00116	658 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SOCS6	O14544	535 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ALOX12B	O75342	701 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ERLIN1	O75477	346 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	BMP10	O95393	424 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN9	O95484	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SERPIND1	P05546	499 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	IL1RN	P18510	177 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	KRT4	P19013	534 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	EMP2	P54851	167 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MLLT10	P55197	1068 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	HERVK_113	P63132	956 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PHEX	P78562	749 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	KCNC4	Q03721	635 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	KLC1	Q07866	573 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	OR7G3	Q8NG95	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	FAR2	Q96K12	515 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	GPR83	Q9NYM4	423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	SENP1	Q9P0U3	644 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-231	ENST00000557549	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms