RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LNP1A1A4G5 178 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GJE1A6NN92 205 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR10H2O60403 315 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AKR7A3O95154 331 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SNAPINO95295 136 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NDST3O95803 873 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CYC1P08574 325 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MIPP30301 263 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC1A6P48664 564 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GSK3AP49840 483 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NME5P56597 212 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TTC23Q5W5X9 447 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SVBPQ8N300 66 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 POC1BQ8TC44 478 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC38A4Q969I6 547 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NTAN1Q96AB6 310 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf34Q96L11 122 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf66Q96MD2 445 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR2M2Q96R28 347 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA3CQ99985 751 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MGME1Q9BQP7 344 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL8Q9H568 366 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HCN2Q9UL51 889 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BANF1O75531 89 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RFPL3O75679 317 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 POU2F2P09086 479 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN19P0C672 248 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MAGP20916 626 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CRABP1P29762 137 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NTSR1P30989 418 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CSKP41240 450 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF4P43489 277 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NUDT2P50583 147 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC26A5P58743 744 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NAE1Q13564 534 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RUNX3Q13761 415 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HNF4GQ14541 408 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC29A2Q14542 456 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CBWD6Q4V339 395 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf64Q86WR6 236 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TXN2Q99757 166 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OPTCQ9UBM4 332 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM150BA6NC51 233 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RNF212BA8MTL3 300 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINA1P01009 418 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C6P13671 934 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN7P35236 360 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADRA1BP35368 520 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF9P41273 254 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GRIA4P48058 902 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KCNC3Q14003 757 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GRM2Q14416 872 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BAK1Q16611 211 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NRF1Q16656 503 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP7Q16829 419 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP6Q5VW22 663 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.1□□□□□ -1.43
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