RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00696Q6ZRV3 163 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD37Q7Z713 158 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT78Q8N1N4 520 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CA13Q8N1Q1 262 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF175Q8N4F7 328 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRT6Q8N6T7 355 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMF1Q92530 271 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GAL3ST3Q96A11 431 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPLA2Q96AD5 504 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1F2PQ96R84 312 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RIC8BQ9NVN3 520 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 XPR1Q9UBH6 696 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 OPTCQ9UBM4 332 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 LRIT2A6NDA9 550 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL8A6PVC2 850 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM227AF5H4B4 570 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 K7EPI3 171 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK8O60259 260 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GFAPP14136 432 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CERS1P27544 350 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX11P35716 441 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MSH2P43246 934 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 UQCRFS1P47985 274 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF8Q02556 426 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 E2F2Q14209 437 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ABRAXAS2Q15018 415 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAP2Q15057 778 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC91Q7Z6B0 441 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CUZD1Q86UP6 607 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KBTBD2Q8IY47 623 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX9Q8N6V9 391 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CPT1CQ8TCG5 803 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D20Q96BZ9 403 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 AGAP4Q96P64 663 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RHBGQ9H310 441 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 NT5DC2Q9H857 520 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGFRNQ9P2B2 879 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF180Q9UJW8 692 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SYCE1LA8MT33 242 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALT2O60909 372 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BGRLO75368 114 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC3AO75596 197 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 WFS1O76024 890 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINB9P50453 376 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BTN3A2P78410 334 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 BTG2P78543 158 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ADPRMQ3LIE5 342 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IGFL2Q6UWQ7 119 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TAOK1Q7L7X3 1001 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 METTL21AQ8WXB1 218 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS50Q96JG6 964 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IMMP1LQ96LU5 166 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 QRFPRQ96P65 431 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CSF3RQ99062 836 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPS2Q9BXY5 557 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CLMPQ9H6B4 373 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 COL12A1Q99715 3063 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 F10P00742 488 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA7P05543 415 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PCNAP12004 261 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MAOAP21397 527 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G16P53816 162 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 RUNX2Q13950 521 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TBCCQ15814 346 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SFT2D3Q587I9 215 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KLC3Q6P597 504 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZS92 163 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 HPS6Q86YV9 775 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLQ8NG68 377 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf60Q96EN9 201 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 CNDP1Q96KN2 507 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 F2RL3Q96RI0 385 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A8Q9BY19 250 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP2-218ENST00000511185 URADA6NGE7 173 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKDD1BA6NHY2 528 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEB17A8MXT2 336 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 E2F3O00716 465 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT38O76015 456 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms