RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMC2Q8NEN0 867 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9A4Q8NGU2 314 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 RGMAQ96B86 450 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 MS4A6EQ96DS6 147 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM10Q96HG1 83 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CNDP1Q96KN2 507 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 QRFPRQ96P65 431 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 FRG2BQ96QU4 278 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 SERINC2Q96SA4 455 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CRB3Q9BUF7 120 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 SPNS1Q9H2V7 528 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 VIPAS39Q9H9C1 493 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 BRF2Q9HAW0 419 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 MS4A12Q9NXJ0 267 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC14CA4D256 554 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 G3V2L1 256 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CLDN4O14493 209 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 OR7A17O14581 309 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ERI3O43414 337 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CRCPO75575 148 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ESRRBO95718 433 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 RNH1P13489 461 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 IL1RNP18510 177 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CD22P20273 847 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 HMOX2P30519 316 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 NAGLUP54802 743 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 EMP2P54851 167 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 BTN3A2P78410 334 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBB8Q3ZCM7 444 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB134Q4QY38 66 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC50Q53HI1 259 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 LCN10Q6JVE6 187 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 COX15Q7KZN9 410 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 PAGE2Q7Z2X7 111 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4F6Q8NGB9 312 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51Q1Q8NH59 317 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 HUS1BQ8NHY5 278 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 TCP10LQ8TDR4 215 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM237Q96Q45 408 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 MS4A8Q9BY19 250 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 ADNPQ9H2P0 1102 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 PFDN4Q9NQP4 134 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A11Q9NSA0 550 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 EMCNQ9ULC0 261 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 LHX6Q9UPM6 363 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 FREM2Q5SZK8 3169 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 CACNA1BQ00975 2339 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC14BA6NHZ5 514 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC16AO15027 2179 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 NKX2-8O15522 239 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 TYROBPO43914 113 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAMEF4O60810 478 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 GUCY1B2O75343 617 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 ULK1O75385 1050 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA3DO95025 777 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 BMP10O95393 424 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 CHEK2O96017 543 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKAR1AP10644 381 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 ICAM2P13598 275 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC18A1P54219 525 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH13P55290 713 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB8AP61006 207 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 TRAF3Q13114 568 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 BIKQ13323 160 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 ABHD17CQ6PCB6 329 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 AMER3Q8N944 861 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR20Q8TBZ3 569 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL6Q8TCB7 284 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOMQ8WWX9 145 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D20Q96BZ9 403 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 MOCOSQ96EN8 888 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 SPSB2Q99619 263 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 MACROD1Q9BQ69 325 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms