RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	METTL6	Q8TCB7	284 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	AGAP11	Q8TF27	550 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	STARD8	Q92502	1023 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	FKBP10	Q96AY3	582 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	MIEF2	Q96C03	454 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	FRG2B	Q96QU4	278 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	OR51B5	Q9H339	312 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF225	Q9UK10	706 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	BIRC5	O15392	142 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	NPHS1	O60500	1241 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SASH3	O75995	380 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ONECUT2	O95948	504 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PDYN	P01213	254 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	KRT6A	P02538	564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	KRT6B	P04259	564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FOLR3	P41439	243 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	KRT6C	P48668	564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	OLR1	P78380	273 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MPP2	Q14168	576 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	NKG7	Q16617	165 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	VWA2	Q5GFL6	755 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SH3GL2	Q99962	352 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TRMO	Q9BU70	441 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FAM117A	Q9C073	453 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	AICDA	Q9GZX7	198 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	CTSF	Q9UBX1	484 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TCFL5	Q9UL49	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TIMM22	Q9Y584	194 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	CDC14C	A4D256	554 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	C4orf51	C9J302	202 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MANBA	O00462	879 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	NKX2-8	O15522	239 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	B3GALT2	O43825	422 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ULK1	O75385	1050 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PRKAR1A	P10644	381 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	SSR2	P43308	183 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FOXL2	P58012	376 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	VAC14	Q08AM6	782 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PCM1	Q15154	2024 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	CHI3L2	Q15782	390 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TTMP	Q5BVD1	217 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	CUZD1	Q86UP6	607 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	AMER3	Q8N944	861 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	RGMA	Q96B86	450 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-208	ENST00000485019	PEX11G	Q96HA9	241 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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