RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 J3QKU1 62 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 WFS1O76024 890 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PCNAP12004 261 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EPORP19235 508 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 JAK1P23458 1154 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CASRP41180 1078 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TGM3Q08188 693 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GTF2H2Q13888 395 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TM9SF4Q92544 642 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MS4A6EQ96DS6 147 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PHF21BQ96EK2 531 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RHBGQ9H310 441 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RIC8BQ9NVN3 520 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 FHP07954 510 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 COX6A1P12074 109 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ICAM2P13598 275 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CD22P20273 847 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PLA2G16P53816 162 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 AP2B1P63010 937 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDH1Q08174 1060 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 COLEC12Q5KU26 742 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LIPJQ5W064 366 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PLPP5Q8NEB5 264 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 AGAP4Q96P64 663 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MESP1Q9BRJ9 268 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ACTR8Q9H981 624 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TBK1Q9UHD2 729 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A0G2JN53 185 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ESPNB1AK53 854 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 B4GALT2O60909 372 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJB6O75190 326 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 UQCRHP07919 91 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINB1P30740 379 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 E2F2Q14209 437 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NSDHLQ15738 373 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GRHL2Q6ISB3 625 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SHISA5Q8N114 240 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ZADH2Q8N4Q0 377 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2L5Q8NG80 312 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MFRPQ9BY79 579 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 AICDAQ9GZX7 198 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF700Q9H0M5 742 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 IPPKQ9H8X2 491 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 SPTA1P02549 2419 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1W2PQ72 361 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 OR2W5A6NFC9 320 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 STX16O14662 325 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 B3GALT2O43825 422 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 UGDHO60701 494 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 TAC1P20366 129 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PHEXP78562 749 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 Q0VFX4 171 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 PCOLCEQ15113 449 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 NADK2Q4G0N4 442 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LANCL3Q6ZV70 420 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CHSY3Q70JA7 882 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LCA5Q86VQ0 697 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 LAS2Q8IYD9 372 aa18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4-209ENST00000484097 CA13Q8N1Q1 262 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms