RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 OLAHQ9NV23 265 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LACTBL1A8MY62 500 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DPM1O60762 260 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SNNO75324 88 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 POP4O95707 220 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ELNP15502 786 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CD52P31358 61 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TAP2Q03519 686 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 MPP2Q14168 576 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 BTBD16Q32M84 506 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ9Q92806 393 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 LINGO1Q96FE5 620 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SPACA7Q96KW9 195 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CWH43Q9H720 699 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ABCB9Q9NP78 766 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 ENPP5Q9UJA9 477 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 OR1J4Q8NGS1 313 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 SCML1Q9UN30 329 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 CRISP1P54107 249 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 RAB1AP62820 205 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 KBTBD6Q86V97 674 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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