RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6AP2O75787 350 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SMIM10L1P0DMW3 83 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 AQP5P55064 265 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RAB8AP61006 207 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MAVSQ7Z434 540 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MVB12AQ96EY5 273 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SMIM10Q96HG1 83 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf109Q9NX04 203 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa26.4■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PMS2P1A4D2B8 440 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 LSM1O15116 133 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TIAF1O95411 115 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ACSM2AQ08AH3 577 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 AP5B1Q2VPB7 878 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 ACSM2BQ68CK6 577 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 RHBDD2Q6NTF9 364 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL10Q6ZVT0 673 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 PAGE2Q7Z2X7 111 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH9Q86YJ5 346 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 METTL4Q8N3J2 472 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 B3GNT4Q9C0J1 378 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 LRTM1Q9HBL6 345 aa26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GIPC1-201ENST00000345425 SDHDO14521 159 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 DIAPH2O60879 1101 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 SSR2P43308 183 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GABREP78334 506 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 FOXC1Q12948 553 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 OR4C11Q6IEV9 310 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 EPGNQ6UW88 154 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CPLX4Q7Z7G2 160 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CHTF18Q8WVB6 975 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 DSCR3O14972 297 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 SEC22BO75396 215 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 TNFSF15O95150 251 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GALNTL6Q49A17 601 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB134Q4QY38 66 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 UBE3DQ7Z6J8 389 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT13Q86X67 352 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 PMEPA1Q969W9 287 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CLIP3Q96DZ5 547 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 APIPQ96GX9 242 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 QRFPRQ96P65 431 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 EPN3Q9H201 632 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 NDOR1Q9UHB4 597 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 DCTN4Q9UJW0 460 aa26.38■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GX78 115 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf51C9J302 202 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 PEX11AO75192 247 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 NSA2O95478 260 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 IL1RNP18510 177 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 ALAS2P22557 587 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 EPHA3P29320 983 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 AVPR1BP47901 424 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 BTN3A2P78410 334 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CGB2Q6NT52 195 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 ACAD11Q709F0 780 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 ULBP3Q9BZM4 244 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 NRSN2Q9GZP1 204 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 FAM107BQ9H098 131 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 AKTIPQ9H8T0 292 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM7Q9NQW5 492 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 ADAM29Q9UKF5 820 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 CDC14AQ9UNH5 594 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 TMED5Q9Y3A6 229 aa26.37■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JN53 185 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 RTCAO00442 366 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 MED26O95402 600 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 PRMT9Q6P2P2 845 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 COMMD6Q7Z4G1 85 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 RFWD2Q8NHY2 731 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 PROKR1Q8TCW9 393 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 STON2Q8WXE9 905 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 SIRT5Q9NXA8 310 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL14Q9P2G3 628 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa26.36■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0G2JND7 137 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8OA6NCC3 632 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 GOLGA8NF8WBI6 632 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 MYO1DO94832 1006 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0754O94854 1291 aa26.35■■□□□ 1.81
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL18O94889 574 aa26.35■■□□□ 1.81
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