RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RFXANKO14593 260 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT8O14734 319 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ZW10O43264 779 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT36O76013 467 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 BAG2O95816 211 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFIP1P53367 373 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RAE1P78406 368 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPEQ05469 1076 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TGM3Q08188 693 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf80Q0P641 193 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 BIRC2Q13490 618 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf61Q13536 156 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR18Q14330 331 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TEAD4Q15561 434 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA24Q86W54 205 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.861e-6■■■□□ 15.9
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RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ8BQ96D53 544 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1MQ96MI6 270 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 F2RL3Q96RI0 385 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP26Q9BV47 211 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SARGQ9BW04 601 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A8Q9BY19 250 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 REEP4Q9H6H4 257 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A14Q9HCY8 104 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LPI6 279 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GSAPA4D1B5 854 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 EVPLLA8MZ36 301 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFSF14O43557 240 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 GCKP35557 465 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK12P53778 367 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4F2P78329 520 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 PLIN5Q00G26 463 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 RELAQ04206 551 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNIQ14094 377 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 RABL3Q5HYI8 236 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf74Q86VG3 221 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 NAGSQ8N159 534 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.66□□□□□ -0.86
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RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 EFHD1Q9BUP0 239 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC61Q9BV99 259 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG2Q9H553 416 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MYNNQ9NPC7 610 aa9.66□□□□□ -0.86
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