RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 FOXM1Q08050 763 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TCTE1Q5JU00 501 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 RGMAQ96B86 450 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 CENPKQ9BS16 269 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.85■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 FER1L5A0AVI2 2057 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 EFCAB7A8K855 629 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 UBDO15205 165 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 OR2B3O76000 313 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 MED26O95402 600 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 DIO3P55073 304 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ACY1Q03154 408 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 EMX2Q04743 252 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 IL23RQ5VWK5 629 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 FCRL1Q96LA6 429 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 C10orf90Q96M02 699 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 SCN2AQ99250 2005 aa20.84■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 URADA6NGE7 173 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TXNDC9O14530 226 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 PCDH7O60245 1069 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 BSGP35613 385 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 SSR2P43308 183 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 ITGA1P56199 1179 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TERF2Q15554 542 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 SMU1Q2TAY7 513 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 MANEAQ5SRI9 462 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 AMER3Q8N944 861 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 RNF31Q96EP0 1072 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 AIG1Q9NVV5 245 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 AHSPQ9NZD4 102 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.83■□□□□ 0.93
STX4-201ENST00000313843 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 HYKKA2RU49 373 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 KLK1P06870 262 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 IL1RNP18510 177 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 ABHD13Q7L211 337 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 NUDT13Q86X67 352 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 LIX1Q8N485 282 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 OR8K5Q8NH50 307 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 SMIM10Q96HG1 83 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 KCNC2Q96PR1 638 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 APMAPQ9HDC9 416 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 LOXL2Q9Y4K0 774 aa20.82■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 FITM1A5D6W6 292 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 FCHO1O14526 889 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 MYO1DO94832 1006 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 BCKDHAP12694 445 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 CCL4P13236 92 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 SDC1P18827 310 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 TACR1P25103 407 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 CERS1P27544 350 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 BTN3A2P78410 334 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 TGM3Q08188 693 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 GRM7Q14831 915 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 DEFB134Q4QY38 66 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 GPR135Q8IZ08 494 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 BMPERQ8N8U9 685 aa20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
STX4-201ENST00000313843 QRFPRQ96P65 431 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms