RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228918.8

LTBR-201, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTBR, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-201ENST00000228918 VWCEQ96DN2 955 aa15.63■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 VPS35Q96QK1 796 aa15.63■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 RAD18Q9NS91 495 aa15.63■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.63■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 METTL15A6NJ78 407 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ANXA8P13928 327 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TIMP2P16035 220 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CA8P35219 290 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CTSKP43235 329 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CDH12P55289 794 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SCARB2Q14108 478 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 INAVAQ3KP66 663 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 LGI4Q8N135 537 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 AMBNQ9NP70 447 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CREBZFQ9NS37 354 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 THSD1Q9NS62 852 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SPASTQ9UBP0 616 aa15.62■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 C6orf47O95873 294 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 C8AP07357 584 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 GABRB1P18505 474 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 GADD45AP24522 165 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PDHA2P29803 388 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MAPK9P45984 424 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 OR1E2P47887 323 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TBPL1P62380 186 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TEKQ02763 1124 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 RBBP4Q09028 425 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MICAQ29983 383 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ZNF404Q494X3 552 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ARSIQ5FYB1 569 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 OR52J3Q8NH60 311 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 NFKBIDQ8NI38 313 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 REPS1Q96D71 796 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 FOPNLQ96NB1 174 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DACH2Q96NX9 599 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MMP27Q9H306 513 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 LTBP2Q14767 1821 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 GNRH1P01148 92 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CCR2P41597 374 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PDE7AQ13946 482 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MAPK11Q15759 364 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TMEM215Q68D42 235 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DPPA4Q7L190 304 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ZNF480Q8WV37 535 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.61■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 A8MVJ9 347 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CTSLP07711 333 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 FURINP09958 794 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 NUDT6P53370 316 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DEFB103AP81534 67 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 USP43Q70EL4 1123 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 WDR34Q96EX3 536 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 RAD9AQ99638 391 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TCF25Q9BQ70 676 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 POLE4Q9NR33 117 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ASAH2Q9NR71 780 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 C1GALT1Q9NS00 363 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 GBAP04062 536 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ADORA3P0DMS8 318 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TYRP14679 529 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 GRK5P34947 590 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MC1RQ01726 317 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DMC1Q14565 340 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 MPEG1Q2M385 716 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 NLRP8Q86W28 1048 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 LACC1Q8IV20 430 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 OXR1Q8N573 874 aa15.6■□□□□ 0.09
LTBR-201ENST00000228918 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms