RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592674.1

RPRD1A-211, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1A, Length 566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-211ENST00000592674 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 CHSY3Q70JA7 882 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 ABHD13Q7L211 337 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 F2RL3Q96RI0 385 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 HBEGFQ99075 208 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 SORT1Q99523 831 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 SPRY4Q9C004 299 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 AICDAQ9GZX7 198 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 OR51B5Q9H339 312 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 THAP1Q9NVV9 213 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 PCM1Q15154 2024 aa14.71□□□□□ -0.05
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 STMND1H3BQB6 276 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ALOX12P18054 663 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 IL1RNP18510 177 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 RORAP35398 523 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 RAP1GDS1P52306 607 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PLA2G16P53816 162 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 RAB8AP61006 207 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TGM3Q08188 693 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 FAM53BQ14153 422 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 HERC3Q15034 1050 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 DEFB134Q4QY38 66 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 DSELQ8IZU8 1212 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 OR2L5Q8NG80 312 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MAGEB18Q96M61 343 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 LRFN5Q96NI6 719 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 GBP5Q96PP8 586 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 SERPINI1Q99574 410 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 CENPKQ9BS16 269 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 BRF2Q9HAW0 419 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PPT2Q9UMR5 302 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.7□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A0G2JN53 185 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 C4orf51C9J302 202 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MEN1O00255 615 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 FOXS1O43638 330 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 RAD1O60671 282 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ETHE1O95571 254 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 B3GALT4O96024 378 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 HSD3B1P14060 373 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 AGXTP21549 392 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 HSD3B2P26439 372 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 AVPR1BP47901 424 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF33BQ06732 778 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ABHD18Q0P651 414 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 CUL3Q13618 768 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MAP7Q14244 749 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 HOMEZQ8IX15 550 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MR1Q95460 341 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MVB12AQ96EY5 273 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 FAR2Q96K12 515 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 HAO1Q9UJM8 370 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.69□□□□□ -0.06
RPRD1A-211ENST00000592674 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms