RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 DLG1Q12959 904 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 DEFB134Q4QY38 66 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC91Q7Z6B0 441 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CUZD1Q86UP6 607 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 KRT78Q8N1N4 520 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PSMF1Q92530 271 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SMIM10Q96HG1 83 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 EHD1Q9H4M9 534 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CD274Q9NZQ7 290 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CHST10O43529 356 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 WFS1O76024 890 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TFEBP19484 476 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 GMPRP36959 345 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 RHAGQ02094 409 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CLEC18BQ6UXF7 455 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 LINC00696Q6ZRV3 163 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 ISCA2Q86U28 154 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 FUT8Q9BYC5 575 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 ALG9Q9H6U8 611 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 LANCL2Q9NS86 450 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 MAP10Q9P2G4 905 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 A0A087X1B8 175 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 KERAO60938 352 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 B3GALT4O96024 378 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 FHP07954 510 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CELA2AP08217 269 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 GNLYP22749 145 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 JAK1P23458 1154 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 HNF4AP41235 474 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 UQCRFS1P47985 274 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 GLRBP48167 497 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 KCNC1P48547 511 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 RAB8AP61006 207 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 OLR1P78380 273 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 PDK4Q16654 411 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 MROH9Q5TGP6 573 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 SIRT6Q8N6T7 355 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 SNX31Q8N9S9 440 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 EXT2Q93063 718 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 ESAMQ96AP7 390 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 WDR34Q96EX3 536 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 FMO2Q99518 471 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 AICDAQ9GZX7 198 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 KLHL31Q9H511 634 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 ACSS3Q9H6R3 686 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 ACOT9Q9Y305 439 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 NBASA2RRP1 2371 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 SCN2AQ99250 2005 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC189A1A4V9 331 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 HMX2A2RU54 273 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 OR2W5A6NFC9 320 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 DNAJB6O75190 326 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 SUPT3HO75486 399 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD8-204ENST00000544999 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms