RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 GLOD4Q9HC38 313 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 C11orf16Q9NQ32 467 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CENPMQ9NSP4 180 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PYCARDQ9ULZ3 195 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.07□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR6C74A6NCV1 312 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GABRR3A8MPY1 467 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 RFXANKO14593 260 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 DVL1O14640 695 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GPRIN2O60269 458 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CDH16O75309 829 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PIAS2O75928 621 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 MMP1P03956 469 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ALPPL2P10696 532 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP3K8P41279 467 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CSN1S1P47710 185 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CORO7P57737 925 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 IL13RA1P78552 427 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXK1P85037 733 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK6Q00534 326 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CLCQ05315 142 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GRTP1Q5TC63 336 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 BBS12Q6ZW61 710 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 FA2HQ7L5A8 372 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PGBD5Q8N414 524 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF611Q8N823 705 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 HERVK_113Q902F9 699 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKS1AQ92625 1134 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 HINT2Q9BX68 163 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TASP1Q9H6P5 420 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 POT1Q9NUX5 634 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 MYOTQ9UBF9 498 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 CD300AQ9UGN4 299 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 NUDT19A8MXV4 375 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PRAMEF4O60810 478 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 UTS2O95399 124 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR8U8P0C7N1 319 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 RD3LP0DJH9 198 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 IDH3AP50213 366 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 MMP15P51511 669 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF136P52737 540 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SP4Q02446 784 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC41Q15345 812 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GPR19Q15760 415 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 FITM2Q8N6M3 262 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR2T33Q8NG76 320 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 OR1J1Q8NGS3 322 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF599Q96NL3 588 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 GDE1Q9NZC3 331 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A1W2PPV4 95 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 I3L521 148 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 I6L893 689 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 PSMD9O00233 223 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCD4O14678 606 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC27A2O14975 620 aa3.06□□□□□ -1.92
JMJD1C-210ENST00000542921 ATG13O75143 517 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms