RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, human

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB4-210	ENST00000522344	GP9	P14770	177 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	MYOG	P15173	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PIK3R1	P27986	724 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KRT20	P35900	424 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ATP4B	P51164	291 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CLDN17	P56750	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ERVK-16	P61578	105 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	BTG1	P62324	171 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SULT2A1	Q06520	285 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	COG2	Q14746	738 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SUSD4	Q5VX71	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NSMAF	Q92636	917 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	IL12RB2	Q99665	862 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KIF27	Q86VH2	1401 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SHISA7	A6NL88	538 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344		E5RGE8	158 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	LDHC	P07864	332 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ADORA3	P0DMS8	318 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TCF4	P15884	667 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SELE	P16581	610 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	AZU1	P20160	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C4BPB	P20851	252 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	GIF	P27352	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SSTR1	P30872	391 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	GPR183	P32249	361 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RGS7	P49802	495 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	EIPR1	Q53HC9	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344		Q6ZR54	194 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CHST3	Q7LGC8	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CASP10	Q92851	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PSMB7	Q99436	277 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C5AR2	Q9P296	337 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	NEDD4	P46934	1319 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PDHX	O00330	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	OGT	O15294	1046 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	GPRIN2	O60269	458 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KIF5C	O60282	957 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PRAF2	O60831	178 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	DNTT	P04053	509 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CD59	P13987	128 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	CDC25C	P30307	473 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PKLR	P30613	574 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	APCDD1	Q8J025	514 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	P2RX5	Q93086	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CPEB4-210	ENST00000522344	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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