RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519885.5

TRAPPC2-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2-208ENST00000519885 CD200R1Q8TD46 325 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 HMGB4Q8WW32 186 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ELMO1Q92556 727 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 UBE2E3Q969T4 207 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ARRDC3Q96B67 414 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 REPS1Q96D71 796 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 L3HYPDHQ96EM0 354 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 COX14Q96I36 57 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 COG8Q96MW5 612 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 BIRC8Q96P09 236 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GPHA2Q96T91 129 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SLC38A3Q99624 504 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TEX101Q9BY14 249 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 DRC3Q9H069 523 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PARVBQ9HBI1 364 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TMEM160Q9NX00 188 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SPATA7Q9P0W8 599 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 NTMQ9P121 344 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 OARD1Q9Y530 152 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PSAT1Q9Y617 370 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SCN8AQ9UQD0 1980 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 CDHR4A6H8M9 788 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 OR2W5A6NFC9 320 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 C9orf118A6NHY6 69 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 MEI4A8MW99 385 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 H0Y3Z8 333 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GOLGA8RI6L899 631 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 MATN2O00339 956 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 EBAG9O00559 213 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 SLC22A2O15244 555 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GRID2O43424 1007 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 LAMTOR5O43504 91 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SUPT3HO75486 399 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 CRCPO75575 148 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GJB3O75712 270 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PIAS2O75928 621 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ATP5HO75947 161 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SLCO2B1O94956 709 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TRIM16O95361 564 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 HSPA4LO95757 839 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 VIPP01282 170 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 PCCBP05166 539 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 CD1DP15813 335 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 AOC1P19801 751 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SAT1P21673 171 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 IDSP22304 550 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 CD27P26842 260 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 FMO4P31512 558 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 GKP32189 559 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC2-208ENST00000519885 LCP2Q13094 533 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ATP1A4Q13733 1029 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 RCN2Q14257 317 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 NFATC4Q14934 902 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 TGFBIQ15582 683 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 CHI3L2Q15782 390 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC2-208ENST00000519885 ANKS6Q68DC2 871 aa4.75□□□□□ -1.65
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