RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516232.1

RNA5SP228-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 228, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP228, Length 133 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP228-201ENST00000516232 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TLCD2A6NGC4 264 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF716A6NP11 495 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C21orf140B9A014 251 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZWINTO95229 277 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NDUFA10O95299 355 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GNA14O95837 355 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHEK2O96017 543 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GHRHP01286 108 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PRNPP04156 253 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ABHD2P08910 425 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF735P0CB33 412 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRIM49P0CI25 452 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRIM49CP0CI26 452 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 EPORP19235 508 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CYP2A7P20853 494 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CPN2P22792 545 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MYF6P23409 242 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GPD2P43304 727 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TAS2R40P59535 323 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DSTNP60981 165 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SSTP61278 116 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GPLD1P80108 840 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GTF2BQ00403 316 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TNFRSF17Q02223 184 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MGAT2Q10469 447 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NR1D2Q14995 579 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 STK38Q15208 465 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MAN2A1Q16706 1144 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NRN1LQ496H8 165 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KRT79Q5XKE5 535 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 Q6ZS92 163 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MPP5Q8N3R9 675 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C12orf29Q8N999 325 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ACBD4Q8NC06 268 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SETD9Q8NE22 299 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PATE1Q8WXA2 126 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SLC9A6Q92581 669 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RFKQ969G6 155 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HMCESQ96FZ2 354 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PGM2Q96G03 612 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PGAM5Q96HS1 289 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 INTS14Q96SY0 518 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NEU1Q99519 415 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 NTMT1Q9BV86 223 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TLR10Q9BXR5 811 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HDAC8Q9BY41 377 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 RNF32Q9H0A6 362 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 POFUT1Q9H488 388 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 LHX9Q9NQ69 397 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PADI1Q9ULC6 663 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.89□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 ZANQ9Y493 2812 aa4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A075B6Q4 140 aa4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A0G2JK05 382 aa4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A0U1RQS6 177 aa4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.88□□□□□ -1.63
RNA5SP228-201ENST00000516232 A0A1B0GTH6 734 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms