RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 KRT81Q14533 505 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 IYDQ6PHW0 289 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ESX1Q8N693 406 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 MUL1Q969V5 352 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 HDAC11Q96DB2 347 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 NT5MQ9NPB1 228 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ITPR2Q14571 2701 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CHUKO15111 745 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 VEGFDO43915 354 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 STK17BO94768 372 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 SERPING1P05155 500 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 KRT7P08729 469 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CTPS1P17812 591 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CAPZBP47756 277 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 SPINT3P49223 89 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 IL11RAQ14626 422 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 C4orf46Q504U0 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM74Q86UV6 250 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 STARD8Q92502 1023 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 NUP85Q9BW27 656 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM4Q9C037 500 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 RAB33BQ9H082 229 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 THAP2Q9H0W7 228 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 POT1Q9NUX5 634 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CD84Q9UIB8 345 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 LRBAP50851 2863 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 A0A087WV62 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 GRID2O43424 1007 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ13O60928 360 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PROSCO94903 275 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CLDN7O95471 211 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 EML2O95834 649 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 MT-ND3P03897 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 HLA-DQB2P05538 268 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ACP5P13686 325 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PBX1P40424 430 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PROK1P58294 105 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZBED6P86452 979 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 KLRB1Q12918 225 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 P3H2Q8IVL5 708 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 TRAM1L1Q8N609 369 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 NCSTNQ92542 709 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-222ENST00000514552 C9orf72Q96LT7 481 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms