RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GOSR1	O95249	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHE	P01854	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	UROS	P10746	265 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SERPINB6	P35237	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PMP22	Q01453	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	DRP2	Q13474	957 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GRB14	Q14449	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MTF1	Q14872	753 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FUT11	Q495W5	492 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CASP10	Q92851	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OMA1	Q96E52	524 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A087X0K7	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SURF4	O15260	269 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MLNR	O43193	412 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TYMP	P19971	482 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KHK	P50053	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FKBP1B	P68106	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	IRX4	P78413	519 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ACKR1	Q16570	336 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PRV1	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEB2	O15479	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GRAP2	O75791	330 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CEACAM4	O75871	244 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	VCL	P18206	1134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	WBP2	Q969T9	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MED20	Q9H944	212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	RTN2	O75298	545 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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