RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 PCSK5Q92824 1860 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GSAPA4D1B5 854 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 A6NL46 340 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNN4O15554 427 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM20BO75063 409 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 METTL18O95568 372 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN1O95832 211 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHEP01854 428 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 UMODP07911 640 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ADH4P08319 380 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CD63P08962 238 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GYPEP15421 78 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT2B7P16662 529 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TPH1P17752 444 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGAXP20702 1163 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MAKP20794 623 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AGXTP21549 392 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CTNNA2P26232 953 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GZMKP49863 264 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TMPRSS15P98073 1019 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CACNG1Q06432 222 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SPARCL1Q14515 664 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPSAP1Q14558 356 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DCAF10Q5QP82 559 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AADACL2Q6P093 401 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PACS1Q6VY07 963 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZS92 163 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MRGPREQ86SM8 312 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT16Q8N428 558 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 INPP5DQ92835 1189 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PTERQ96BW5 349 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MENTQ9BUN1 341 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS37BQ9H9H4 285 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LUZP4Q9P127 313 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 POLG2Q9UHN1 485 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0J9YY10 115 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 C9J4A7 227 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 QSOX1O00391 747 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT86O43790 486 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GPC4O75487 556 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR2B3O76000 313 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TJP3O95049 919 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AP2A1O95782 977 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ENPP1P22413 925 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXN2P32314 431 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SHMT2P34897 504 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NSG1P42857 185 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MASP1P48740 699 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RWDD2BP57060 319 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXL2P58012 376 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RAPSNQ13702 412 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GRB7Q14451 532 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ITIH4Q14624 930 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KIR2DS3Q14952 304 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 KYNUQ16719 465 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 MLIPQ5VWP3 458 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM73Q86UV7 250 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB43Q86YS6 212 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 IQCKQ8N0W5 287 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms