RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HBEGF	Q99075	208 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR51B5	Q9H339	312 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATM	Q13315	3056 aa		13.19	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831		K7EM74	188 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR4F21	O95013	312 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TGFB1	P01137	390 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ALOX12	P18054	663 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FOLR3	P41439	243 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HTR6	P50406	440 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PLA2G16	P53816	162 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRKAA2	P54646	552 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EMP3	P54852	163 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BTN3A2	P78410	334 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLC1	Q07866	573 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PWP1	Q13610	501 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RUNX2	Q13950	521 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MPP2	Q14168	576 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LY6D	Q14210	128 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBCC	Q15814	346 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RBBP7	Q16576	425 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UGT8	Q16880	541 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RHBG	Q9H310	441 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		13.18	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TYROBP	O43914	113 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SUPT7L	O94864	414 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRB1	P04280	392 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SERPINA6	P08185	405 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MYL2	P10916	166 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NR1D1	P20393	614 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CERS1	P27544	350 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCNG1	P51959	295 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FOXA1	P55317	472 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HERVK_113	P63132	956 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CLC	Q05315	142 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RGS1	Q08116	209 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM53B	Q14153	422 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.17	□□□□□ -0.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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