RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DTD2Q96FN9 168 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF347Q96SE7 839 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PCDH7O60245 1069 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RHOP08100 348 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RANBP1P43487 201 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 BDKRB1P46663 353 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PREPP48147 710 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PDE7AQ13946 482 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 VMP1Q96GC9 406 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 KIF17Q9P2E2 1029 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 INMTO95050 263 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SELENOWP63302 87 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TEKQ02763 1124 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NPRL3Q12980 569 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 FADDQ13158 208 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MLIPQ5VWP3 458 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CCDC80Q76M96 950 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PRSS48Q7RTY5 328 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PARP8Q8N3A8 854 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ZNF480Q8WV37 535 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NEIL2Q969S2 332 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 UBE2E3Q969T4 207 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 YIPF6Q96EC8 236 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DGCR6LQ9BY27 220 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ADAMDEC1O15204 470 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CISD3P0C7P0 127 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PIK3CBP42338 1070 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RPS13P62277 151 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ATG16L2Q8NAA4 619 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CCDC90BQ9GZT6 254 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 MYNNQ9NPC7 610 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 RGS10O43665 173 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 XPNPEP2O43895 674 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PRNPP04156 253 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 NPPBP16860 134 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CD6P30203 668 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 CRYBA2P53672 197 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-205ENST00000409985 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 LILRB5O75023 590 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF21O75509 655 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 C1QCP02747 245 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OCA2Q04671 838 aa22.83■■□□□ 1.24
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PMS1-205ENST00000409985 AQP6Q13520 282 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SPCS2Q15005 226 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 UNC5DQ6UXZ4 953 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GIPC3Q8TF64 312 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 FCGR1BQ92637 280 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 CLDND1Q9NY35 253 aa22.83■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 MVDP53602 400 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ST8SIA6P61647 398 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 TBPL1P62380 186 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 DPTQ07507 201 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 ELP6Q0PNE2 266 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-205ENST00000409985 GAB1Q13480 694 aa22.82■■□□□ 1.24
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