RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396308.3

VAMP1-202, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene VAMP1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-202ENST00000396308 ETHE1O95571 254 aa14.71□□□□□ -0.05
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VAMP1-202ENST00000396308 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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VAMP1-202ENST00000396308 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.69□□□□□ -0.06
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