RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327367.8

SMAD3-201, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD3, Length 6,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-201ENST00000327367 MTFR1LQ9H019 292 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ABCG5Q9H222 651 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TSPOAP1O95153 1857 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TLL1O43897 1013 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 KCNC4Q03721 635 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CHST9Q7L1S5 443 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 RNF130Q86XS8 419 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 GPR135Q8IZ08 494 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TCEAL3Q969E4 200 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TESCQ96BS2 214 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 NELL2Q99435 816 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.95■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 RHOQP17081 205 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 KELP23276 732 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PRKCZQ05513 592 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CPQQ9Y646 472 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 MT-ND5P03915 603 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SSTR4P31391 388 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 BTN1A1Q13410 526 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 HYAL4Q2M3T9 481 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ARL14Q8N4G2 192 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 COPZ2Q9P299 210 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OR6C6A6NF89 314 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 LMO2P25791 158 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 GJA5P36382 358 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 LCN9Q8WX39 176 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 COQ10AQ96MF6 247 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ARPC5O15511 151 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 GSTM3P21266 225 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 IDSP22304 550 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PTGER3P43115 390 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SLC30A8Q8IWU4 369 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.94■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ALPIP09923 528 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ALDH3B2P48448 385 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 GPATCH2Q9NW75 528 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 FETUBQ9UGM5 382 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 FAM159BA6NKW6 160 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 RBBP9O75884 186 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TSPAN15O95858 294 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 IFNA17P01571 189 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 BDKRB1P46663 353 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ATP6AP1Q15904 470 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 AHSGP02765 367 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SSTR2P30874 369 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 NFATC3Q12968 1075 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 FANK1Q8TC84 345 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SIX2Q9NPC8 291 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 PTPRJQ12913 1337 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ESR1P03372 595 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CAPN3P20807 821 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 OR1D2P34982 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CCL23P55773 120 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 ZNF550Q7Z398 422 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 SMOXQ9NWM0 555 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 CD300AQ9UGN4 299 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.93■□□□□ 0.14
SMAD3-201ENST00000327367 A0A1W2PP18 115 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms