RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 SNAPC3Q92966 411 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DUX4Q9UBX2 424 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RP1P56715 2156 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FXYD1O00168 92 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF33AQ06730 810 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAB21L1Q13394 359 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MTFR2Q6P444 385 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TRPV1Q8NER1 839 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GPR151Q8TDV0 419 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MROQ9BYG7 248 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C5AR2Q9P296 337 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CMAHPQ9Y471 501 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ASB1Q9Y576 335 aa15.17■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GMFGO60234 142 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 EPHA2P29317 976 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GATMP50440 423 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 VLDLRP98155 873 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PPP2R2BQ00005 443 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SEC14L2O76054 403 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAN2A2P49641 1150 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UROC1Q96N76 676 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UCK2Q9BZX2 261 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PQ09 198 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 HCN1O60741 890 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IL7P13232 177 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 Q6ZVL8 140 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C17orf64Q86WR6 236 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GOLM1Q8NBJ4 401 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PSKH2Q96QS6 385 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 IFT52Q9Y366 437 aa15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MUSKO15146 869 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GABARAPL2P60520 117 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GINS1Q14691 196 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 UPP1Q16831 310 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LEXMQ3ZCV2 418 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CARD16Q5EG05 197 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 ADGRF1Q5T601 910 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CRELD1Q96HD1 420 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CLCA1A8K7I4 914 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LIPAP38571 399 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DSTNP60981 165 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 NFATC2Q13469 925 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 FGFBP1Q14512 234 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 GINS4Q9BRT9 223 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 OR6C75A6NL08 312 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 I6L893 689 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 OR1F1O43749 312 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 TNFSF8P32971 234 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 PGFP49763 221 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MAZP56270 477 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 MUL1Q969V5 352 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 CCDC120Q96HB5 630 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP43-201ENST00000285199 F5P12259 2224 aa15.14■□□□□ 0.01
USP43-201ENST00000285199 A0A075B6Q4 140 aa15.14■□□□□ 0.01
USP43-201ENST00000285199 EPOP01588 193 aa15.14■□□□□ 0.01
USP43-201ENST00000285199 HPGDP15428 266 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms