RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL31Q9H511 634 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG2Q9H553 416 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1EQ15878 2313 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 B4DGG1 531 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 COX7A2P14406 83 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 RANBP1P43487 201 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 LSSP48449 732 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPEQ05469 1076 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF385BQ569K4 471 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM71E1Q6IPT2 247 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 AAGABQ6PD74 315 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP21Q8N119 569 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf111Q8N326 155 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10G6Q8NH81 332 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 NELL1Q92832 810 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ8BQ96D53 544 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3GL3Q99963 347 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 VILLO15195 856 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP6O75344 327 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 GSNP06396 782 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ANPEPP15144 967 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGP20916 626 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FNTBP49356 437 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R50P59544 299 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1CAP62136 330 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 HHEXQ03014 270 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE7AQ13946 482 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FXNQ16595 210 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MPEG1Q2M385 716 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CLECL1Q8IZS7 167 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MYNNQ9NPC7 610 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX7Q9UNH6 387 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM131Q92545 1883 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A096LPI6 279 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2A25A4D2G3 310 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFS4O43181 175 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF14O43557 240 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CCNDBP1O95273 360 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FURINP09958 794 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1B2P21281 511 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 HRH2P25021 359 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 AHRP35869 848 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MAZP56270 477 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC34A1Q06495 639 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ELOCQ15369 112 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MUM1Q2TAK8 710 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNEQ86WN2 208 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 LMX1AQ8TE12 382 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ITCHQ96J02 903 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF583Q96ND8 569 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PIF1Q9H611 641 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 GSAPA4D1B5 854 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS11DO60235 418 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF10O60809 474 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CTSVO60911 334 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 GRK3P35626 688 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP4F3Q08477 520 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATS1Q496A3 300 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 CPTPQ5TA50 214 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 FCRL6Q6DN72 434 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms