RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253024.9

TRIM28-201, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM28, Length 2,960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRIM28-201ENST00000253024 SMIM30A4D0T7 59 aa20.48■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 HIDE1A8MVS5 230 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 ELFN1P0C7U0 828 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 PRAMEF10O60809 474 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 APOL3O95236 402 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 EFEMP2O95967 443 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 ADRA2AP08913 450 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 CTSKP43235 329 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 NFE2L1Q14494 772 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRIM28-201ENST00000253024 UCN3Q969E3 161 aa20.46■□□□□ 0.87
TRIM28-201ENST00000253024 LYSMD1Q96S90 227 aa20.46■□□□□ 0.87
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