RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		22.38	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	22.38	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	ESPN	B1AK53	854 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	SRGAP3	O43295	1099 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	BEND3	Q5T5X7	828 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		22.37	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	LGR6	Q9HBX8	967 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PALD1	Q9ULE6	856 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	NCAPD2	Q15021	1401 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD11	A6QL63	1104 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		22.36	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		22.35	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	22.35	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		22.35	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		22.35	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		22.35	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA4	P34932	840 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	BRD1	O95696	1058 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	CNTROB	Q8N137	903 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		22.34	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	MBD3	O95983	291 aa		22.33	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	22.33	■■□□□ 1.17
RRN3-205	ENST00000563559	MTX1	Q13505	466 aa		22.32	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		22.32	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		22.31	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	22.31	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	SGSM2	O43147	1006 aa		22.31	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ALDH1L1	O75891	902 aa		22.31	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	22.31	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	RAD50	Q92878	1312 aa		22.3	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	GPT2	Q8TD30	523 aa		22.3	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY9	O60503	1353 aa		22.29	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	KCNQ3	O43525	872 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	GC	P02774	474 aa		22.27	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHG5	O94827	1062 aa		22.27	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	GPATCH3	Q96I76	525 aa		22.27	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	KSR2	Q6VAB6	950 aa		22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	SLIT3	O75094	1523 aa		22.26	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	IL25	Q9H293	177 aa		22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	HYPK	Q9NX55	129 aa		22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ERBB4	Q15303	1308 aa		22.25	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	HS1BP3	Q53T59	392 aa		22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	22.24	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		22.23	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		22.23	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA1	P04083	346 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	RBSN	Q9H1K0	784 aa		22.22	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	PXDN	Q92626	1479 aa		22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	LINS1	Q8NG48	757 aa		22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	TTC14	Q96N46	770 aa		22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	22.21	■■□□□ 1.15
RRN3-205	ENST00000563559	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		22.2	■■□□□ 1.14

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