RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 HYPKQ9NX55 129 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 SEC24BO95487 1268 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 PDIA6Q15084 440 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 BEND3Q5T5X7 828 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NGLY1Q96IV0 654 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 HMMRO75330 724 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 KSR2Q6VAB6 950 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 DCTPP1Q9H773 170 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 A1BGP04217 495 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ADCY9O60503 1353 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 MSH5O43196 834 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 DDX58O95786 925 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 PIGBQ92521 554 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ATP10DQ9P241 1426 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 SRGAP3O43295 1099 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 DDB1Q16531 1140 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 MYD88Q99836 296 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ABCC6O95255 1503 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NBPF26B4DH59 902 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ATP8B2P98198 1209 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NBPF14Q5TI25 921 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 NBPF15Q8N660 670 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 LINS1Q8NG48 757 aa10.46□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 IGKV5-2P06315 115 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SLC4A3P48751 1232 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 TTLL7Q6ZT98 887 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 ATG3Q9NT62 314 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 GRM8O00222 908 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 CERKQ8TCT0 537 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 KDM3BQ7LBC6 1761 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 ABCA3Q99758 1704 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 FAM182BQ5T319 152 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 ALDH1L1O75891 902 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 PHLPP1O60346 1717 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 HSPA1LP34931 641 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SUCLG2Q96I99 432 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 A0A087WZG4 1122 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 GCKRQ14397 625 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SIL1Q9H173 461 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 KCNQ2O43526 872 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 STARD3NLO95772 234 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SSH3Q8TE77 659 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 USP21Q9UK80 565 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-215ENST00000549143 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms